Vondrák przed wyborami prezydenckimi poparł kontrkandydata Babiša – Petra Pavla, za co spotkała go krytyka ze strony pozostałych wiceprzewodniczących. 

Czeska Agencja Prasowa poinformowała, że szef ANO Andrej Babiš nie chciał komentować decyzji Vondráka. Dziennikarzom powiedział, że konferencje ideowe, które odbyły się w przeszłości, niczego nowego nie wniosły. 

Były rektor Wyższej Szkoły Górniczej–Uniwersytetu Technicznego jest członkiem ANO od 2017 roku. Na razie nie chce rezygnować z członkostwa, choć nie podoba mu się kierunek, w jakim partia zmierza. 

– Kiedy wstępowałem do ruchu ANO, wstępowałem do partii środka, która była liberalna. Był w niej szereg osobistości, które znałem z mojej działalności akademickiej – powiedział Vondrák, dodając, że obecnie ma wrażenie, że partia skręca w lewo.